Para la detección temprana de brotes, el sector Bacteriología del Laboratorio MQ participa del Comité de Infecciones Intranosocomiales del Sanatorio Guemes, en el cual se evalúan mensualmente las tasas de infecciones y el nivel de resistencia antimicrobiana de los microorganismos circulantes,  reportándose  todos estos datos para adoptar en forma conjunta con la Dirección del Sanatorio todas  las medidas necesarias para disminuir los riesgos y evitar la aparición de brotes. 

También se realizan en este sector los controles de esterilización de materiales e instrumental del Sanatorio Güemes.  Eventualmente se hacen los controles de esterilización de quirófanos y controles de portación de Staphilococcus aureus del equipo médico y de enfermería.